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郑金水讲述:细菌的战争

2017-11-25 22:44:22| 查看: 1649|

11月24日晚,在华中农业大学图书馆一楼报告厅举行了第208期学术沙龙,由信息学院郑金水副教授主讲。

【通讯员:付婷婷,赵紫燕】1124日晚,在华中农业大学图书馆一楼报告厅举行了第208期学术沙龙,由信息学院郑金水副教授主讲。郑老师从事基因组学研究十年,第一作者发表基因组学SCI论文8篇,参与发表30篇,正在主持或主持过基因组学相关项目5项,其中包括2项国家自然科学基金。

郑老师一开始以人类社会的战争作为引言,提出了病原菌与宿主之间的战争形式,并以Bc群的种群之争过渡到今天的主要讲述对象:苏云金芽胞杆菌(Bt)。Bt是使用最成功的微生物杀虫剂,Bt毒素基因则是抗虫转基因作物的主要候选基因。郑老师表示长期以来,对于Bt的研究主要集中在其毒素基因的挖掘与应用上。近年来,诸多证据显示,Bt是昆虫的病原菌,也是线虫的病原菌,但与一般高等动物病原菌相比具有一定的特性,包括宿主谱广、含有对宿主具有直接毒杀作用的毒力因子等等。

“我们对Bt与宿主之间的互相作用产生了很大的疑问。”郑老师开始从基因组的角度寻找线索,他用84个鞭毛血清亚型(84个亚种)、152Bc群其它基因组作为材料,运用二代测序、比较基因组学的方法进行研究。紧接着他向大家讲述了基于核心基因的Bc群系统发育树以及Bc群宿主转换分别发生在进化的不同阶段,得出侵染无脊椎动物的Bt与侵染高等动物菌株有着本质的区别。他在实验的过程中对Bt中的毒素基因存在的意义展开了研究得到了毒素共存规律:共存于同一细菌中的毒素往往具有相同的靶标昆虫或线虫。来自公共数据所有的毒素基因共存分析显示,共存规律普遍存在。

郑老师了解到Bt病原性的演化动力与质粒和转作因子有关,他也开展了此方面的研究。“从微生物演化的角度来审视Ba等人类病原菌与Bt之间的差异。”而后郑老师谈到自己的研究初衷是通过探究Bt与宿主之间的互作对高效Bt资源的挖掘的指导意义。在此次学术沙龙快接近尾声的时候,郑老师向大家分享了他以后的研究计划:探寻Bt中是否存在其它形式的宿主转换,比如线虫;毒素是否会无限积累;根据毒素共存网络挖掘新型毒素基因的实践。

审核人:李林

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