第294期:李健英


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主讲人:李健英博士

主题:棉花(泛)基因组研究进展 


棉花(Gossypium)大约52个种,共9种基因组类型,包括二倍体基因组A-G、K和四倍体AD。二倍体棉种染色体数目一致,但基因组大小差异达三倍以上。四倍体陆地棉和海岛棉是世界上广泛种植的两个栽培种,是天然可纺织纤维主要来源。近年来,多个研究团队产生了四倍体棉花重测序数据,解析了人工驯化对于棉花性状改良的位点,然而,单一的参考基因组直接比对导致遗传变异丢失。我们通过构建棉花泛基因组发现了棉花驯化和选择中丢失的序列和基因,解析了纤维品质性状形成的基因组学基础,为进一步的进行棉花精准改良提供基因组学的指导。另一方面,基于参考基因组和染色质互作数据,解析转座子活动驱动的基因组大小进化特征,揭示了转座子扩增与染色体结构元件之间的关系,为研究植物中转座子活动介导的转录调控进化研究提供参考。


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